周瑜的士兵見(jiàn)華佗帶著一幫下人在練五禽戲，并將他們帶到戶外練習(xí)，于是準(zhǔn)備向周瑜稟報(bào)，誰(shuí)知此時(shí)周瑜正在議事，屬下只得等在旁邊。等周瑜議完事聽(tīng)了屬下的匯報(bào)大發(fā)雷霆，趕緊派人追趕。此時(shí)華佗果然帶著靈兒和天來(lái)逃跑，華佗準(zhǔn)備渡江去曹營(yíng)中治療瘟疫。哪知天來(lái)突然打暈華佗并將他捆了起來(lái)。華佗蘇醒后天來(lái)跪在他面前，他希望華佗原諒他的不得已行為，因?yàn)椴懿倥c他有不共戴天之仇，自己又沒(méi)有能力殺曹操，所以他不希望華佗去給曹營(yíng)的官兵治病，哪怕將來(lái)曹操死后自己以命抵那些無(wú)辜官兵的性命。華佗說(shuō)服不了天來(lái)急的正不知如何是好時(shí)，走散了的靈兒這時(shí)找到華佗和天來(lái)藏身的山洞，靈兒也支持華佗的觀念，于是三人劇烈爭(zhēng)執(zhí)起來(lái)。爭(zhēng)吵聲驚動(dòng)了正在樹(shù)林巡邏的夏候勇，夏候勇看到天來(lái)正要?dú)⑺A佗拼命救下天來(lái)。東吳的追兵也已趕來(lái)，夏候勇想帶著華佗撤離。在與東吳追兵爭(zhēng)斗間，天來(lái)和靈兒失足跌下山坡，夏候勇拼命救出了華佗。

華佗到了曹營(yíng)，面對(duì)曹操還是他的那一番勸曹操不要?dú)⒙镜难赞o。曹操為了治療瘟疫讓軍營(yíng)的太醫(yī)們都到了議事大廳，結(jié)果華佗很直接的讓吳成出去，自己不愿與他為伍，因?yàn)橄袼欠N讓病尸隨江而下感染更多人的行為不僅沒(méi)有醫(yī)德連人性都沒(méi)有了。吳成氣的火冒三丈，無(wú)奈華佗堅(jiān)持曹操支持，吳成只得悻悻而走。

曹營(yíng)得瘟疫的官兵得到華佗的醫(yī)治很快轉(zhuǎn)危為安，眾將士對(duì)華佗感恩戴德。這一次前方打仗受傷的士兵因重傷在華佗面前眼睜睜地死掉，再加上吳成的冷嘲熱諷，華佗意識(shí)到自己改變不了時(shí)局，不能阻止殺戮，做不了蒼生大醫(yī)，內(nèi)心非常失落。因?yàn)椴軤I(yíng)里瘟疫已治好，華佗想離開(kāi)曹營(yíng)，曹操苦勸后稱曹營(yíng)中還有一人生病，所以他不能離開(kāi)。

華佗在給病人劉二寶醫(yī)治時(shí)，發(fā)現(xiàn)劉二寶其實(shí)沒(méi)有病，原來(lái)他就是東吳劉奶奶的二兒子。他因大哥得瘟疫而死，家中老母無(wú)人奉養(yǎng)，所以才讓華佗幫他裝病想避開(kāi)戰(zhàn)爭(zhēng)。吳成得知這個(gè)消息后向曹操告密，曹操對(duì)劉二寶臨陣脫逃擾亂軍心的行為大怒，他對(duì)劉二寶進(jìn)行了嚴(yán)懲。華佗已對(duì)曹操?gòu)氐资谑请x開(kāi)了曹操準(zhǔn)備回到家鄉(xiāng)。

華佗回到家鄉(xiāng)，看到了闊別已久的明心，明心面對(duì)華佗更是百感交集，兩人淚如雨下。華佗見(jiàn)沸兒老是被別人欺負(fù)，于是教他學(xué)五禽戲強(qiáng)身健體。天來(lái)和靈兒準(zhǔn)備回譙郡找華佗，兩人走到城門口被守城侍衛(wèi)追殺。他們最后跳入潭中才逃脫出來(lái)。