二十八軍東渡黃河到山西打通抗日道路，同年四月十四日，在與敵人的戰斗中，劉志丹不斷靠前指揮，偵察敵情，不幸中彈犧牲，年僅三十三歲。習仲勛得知消息后策馬東馳，站在山頂看著劉志丹裝殮在一口薄棺中，被軍民抬回了保安，心中悲痛萬分。同年六月，中共中央決定將保安縣更名為志丹縣，毛澤東題詞贊譽劉志丹是“群眾領袖，民族英雄”。

毛澤東在了解有關習仲勛等人的情況，獲悉他們當年被扣右傾帽子，含冤入獄，不禁感慨陜甘根據地讓黨中央和紅軍有了落腳點，全都是這些干部的功勞，可惜劉志丹和謝子長犧牲，很多同志受過太多委屈，他們都是優秀人才，絕對不能大材小用。

一九三六年九月，習仲勛被毛澤東選中破例參加會議，并與毛澤東見了面。如今國民黨調動了十一個師的兵力，瘋狂“圍剿”關中蘇區，習仲勛被中央派往旬邑，擔任關中特委書記，途中遭土匪包圍，馬老三聽到習仲勛會說黑話，對他也早有耳聞，果斷交了他這個朋友，爽快放行。

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等到了旬邑以后，習仲勛召集大家開會說下目前情況。秦木蘭表示敵人施行家家連坐的保甲制度，以瓦解他們的黨組織和游擊隊，以至于很多同志都隱蔽起來，武器槍支就地掩埋，所以關中整體狀況就是要人沒人，要槍沒槍，陷入一種尷尬的境地。

然而習仲勛認為很多同志隱蔽起來，說明沒有投敵并信任黨組織，當務之急就是要盡快聯系各地的黨員，而且要動員所有同志拿起槍恢復組織，與敵人開展斗爭。除此之外，習仲勛勸降一些反動民團，化敵為友，幾個月時間就打開了局面。

同年十二月十二日，張學良、楊虎城在西安發動兵諫扣留蔣介石，中共中央派周恩來等前往西安促成了西安事變的和平解決。也正因如此，這件事成為時局轉換的樞紐，十年內戰的局面基本結束，國內和平初步實現，國共兩黨實行第二次合作，共同抗日。

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隨后習仲勛去見了彭德懷，得知八路軍準備東渡黃河，而他要在一個月內征集三百人的預備營，補充到賀龍的一二零師。可問題是關中蘇區大部分都屬于山區，本地兵源實在太少，郭炳坤跑斷了腿也只招募到三十人，并且這三十人里良莠不齊，身體素質不好。

此時李三娃主動來找習仲勛，表示自己要當兵打鬼子，但習仲勛認為他年紀太小，安排郭炳坤把他送回去，告訴他好好學習知識文化，以后有的是機會貢獻。聽了習仲勛的話，李三娃不再堅持。最終在習仲勛的不懈努力，總算從關中招滿了人，甚至還補充了一個團的人數，令賀龍非常高興，把自己最喜歡的手槍送給他。

一九三七年八月，中共中央革命軍事委員會發布紅軍主力，改編為國民革命軍第八路軍的命令。八路軍各部于八月至十月間，分別從涇陽和富平等地出發，東渡黃河，開赴抗戰前線。習仲勛回到富平，先是去曾經的學校看了一眼，又來到家里，見到了二妹習東英、小妹習雁英以及三叔習宗仁。