青山剛昌原作《名偵探柯南》系列的劇場版.《銀翼的魔術師》內容是描述怪盜基德向名劇場演員牧樹里預告將偷走“命運寶石”,牧樹里只好向毛利小五郎求救,而毛利小五郎猜測怪盜基德應該會在最后一場表演偷走寶石,而會變裝的怪盜基德當天模仿的對象是工藤新一,這讓柯南一眼就識破基德的詭計,阻止竊盜案發生,而牧樹里為了感念毛利小五郎,便安排柯南與小蘭一起到函館游玩,想不到真正的兇殺案才正要發生。
一個女人來到小五郎處,請其幫助看守寶石。這女人名叫牧樹里,是代表著日本的女演員。她收到預告稱有人將會去奪取她所擁有的寶石“命運的寶石”,而預告者正是怪盜基德。小五郎斷言:基德將會在樹里擔任主角的傳統話劇的公演最后一天前來盜寶。于是第二天,柯南,小五郎,小蘭還有少年偵探團一起前往傳統話劇公演的東京汐留。柯南對小五郎的推理充滿疑問,于是自己推理基德的出現。然而,在那里出現的竟是工藤新一!
那個男人再次出現在柯南的面前?柯南能守住寶石嗎!?……然后?
當然,那個新一絕不是真的。但是,要證明那個新一是假的的話,就需要柯南表明自己的身份。基德似乎明白這一點,很大膽的想和小蘭在一起,并且肆意推理基德不會從房頂來;這時,在樹里任主角的舞臺上上演了《約瑟芬王妃》的一幕。被柯南看出真實身份的基德,如何盜走這藍色的寶石呢!?然后,對柯南他們更大的考驗是?