調查全世界“奇跡”真偽的奇跡調查官，平賀·約瑟夫·庚與羅伯托·尼古拉斯·尼古拉斯。他們被掃羅大主教，命令去圣羅薩里奧教會調查。那是主張“懷上了神之子”的修女·多洛麗絲受孕的真偽，還有找到了印證惡魔崇拜疑惑的“蛇之符契”的碎片。在現場開始調查的兩人，感到了教會中有不穩定的氣氛。