森林中，匪徒麥斯憑著自己的地理優(yōu)勢，他們將前來的國際刑警一舉擊敗，就連凌風(fēng)也中了麥斯的招，從高處摔落在地。另一邊，國際刑警傾巢而出，另一拔匪徒趁機(jī)偷襲警局，成功地將坦克救出。凌風(fēng)醒來，他渾身狼狽地來到河邊，突然一道身影靠近了凌風(fēng)，凌風(fēng)憑著自己的本能向來人射槍，直到轉(zhuǎn)身之時，凌風(fēng)這才發(fā)現(xiàn)自己射中之人竟然是樊毅。樊毅掉下河流，凌風(fēng)想抓住樊毅卻無濟(jì)于事。恰逢馬來西亞正在遭受著全日蝕，凌風(fēng)在河邊暈倒過去。

五天后，凌風(fēng)在香港醒來，他從醫(yī)院口中得知他整整昏迷了五天，且體內(nèi)有一種不名的毒素。這時，簡文珊帶著重案組的成員怒氣洶洶前來質(zhì)問凌風(fēng)，他們從一名殉職警官的身上搜出了一份影片，影片里清楚地看到凌風(fēng)射殺了樊毅。凌風(fēng)不相信樊毅已經(jīng)死亡，警員稱他們雖未找到樊毅的尸體，可已經(jīng)在下游找到了他的衣服。除此之外，警方還在凌風(fēng)的家中搜出了兩百萬現(xiàn)金，凌風(fēng)的身上有過吸毒的痕跡，他們懷疑凌風(fēng)勾結(jié)毒販，出賣情報，且殺害樊毅。凌風(fēng)沒有做過這些事情，但全警局都不肯相信他，他只好保持緘默，一心想見自己的律師。

簡文珊獨自回到家中，她想起了自己與樊毅度過的點點滴滴以及樊毅給過自己的浪漫驚喜，心中更加難過，誓要找出殺害樊毅的兇手。病房中，凌風(fēng)回想起在馬來西亞的一切，也驚覺自己在拉著樊毅衣服的時候聽到了避彈衣撕扯的聲音。

樊毅下落不明，簡文珊從鑒證科得知，樊毅必定無法生還。凌風(fēng)開槍已成事實，簡文珊認(rèn)為凌風(fēng)必是殺害樊毅的兇手，康警官出言替凌風(fēng)說話，認(rèn)為凌風(fēng)定不可能做出這種事情，可簡文珊卻只認(rèn)證據(jù)。凌風(fēng)的傷勢已經(jīng)無礙，簡文珊想將凌風(fēng)押回警局繼續(xù)扣留，凌風(fēng)將樊毅可能穿著避彈衣的事情告訴簡文珊，簡文珊卻不相信，執(zhí)意將凌風(fēng)押回警局。途中，凌風(fēng)借著要上洗手間為由逃離了簡文珊的抓捕，簡文珊知道后立即命人搜捕凌風(fēng)。

簡文珊跟蹤凌風(fēng)的妹妹阿雪，凌風(fēng)扮成出租車司機(jī)前來見阿雪，他借阿雪之口讓她轉(zhuǎn)告簡文珊，他自認(rèn)清白，所以他一定會查清樊毅的事情給簡文珊一個交待。簡文珊將凌風(fēng)的動作告知劉警官，她不僅懷疑凌風(fēng)要逃去馬來西亞，更是懷疑起了毒品調(diào)查科的清白，看到簡文珊的的沖動，劉警官出言勸誡簡文珊，切莫情緒用事。隨后，重案組成員調(diào)查起了水港的船只，他們從一個線人的口中得知，凌風(fēng)將在今晚四點乘青衣洪勝船廠的船離開香港。

夜晚，凌風(fēng)來到約定地點，可卻細(xì)心地發(fā)現(xiàn)警局的人正埋伏在碼頭邊，他通知船上的人員先行開船離開。簡文珊察覺不妙，她帶著人攔下船只，可上船搜查卻一無所獲，只好悻悻收隊。看到簡文珊的離開，凌風(fēng)方才現(xiàn)身，他乘坐快艇趕去與船只會合，前往馬來西亞。

吉隆坡，凌風(fēng)前來找阿光，這才得知自己的事情連累了阿光，阿光已經(jīng)被警局革職。阿光想做回警察，凌風(fēng)勸說阿光幫助自己，簡文珊手上的影片少了一些鏡頭，他想拿回影片的正本，從中找出線索。影片的正本在在國際刑警辦公室，阿光想做回警察心切，他假意帶著凌風(fēng)前來見國際刑警的同事，實則是想抓捕凌風(fēng)。幸虧凌風(fēng)反應(yīng)敏捷，機(jī)靈地從阿光的手上逃脫。

凌風(fēng)逃脫的事情傳到了康警官與劉警官的耳中，劉警官無奈一嘆，稱簡文珊也借以休假為由，獨自一人飛往了馬來西亞，二人只希望簡文珊在馬來西亞不要過于情緒用事。馬來西亞 ，阿光回到家中，卻意外看到凌風(fēng)拿槍對準(zhǔn)了自己的妻兒，凌風(fēng)從阿光的口中得知了影片還有另一個鏡頭之后便離開了阿光家，不再勉強(qiáng)阿光。

簡文珊前來國際刑警大廈見郭警官，在郭警官的幫助下，簡文珊可以參與樊毅的案件，但卻沒有任何執(zhí)行權(quán)。郭警官向簡文珊透露，除了香港警方得到的那段影片之外，香港警方還得到了另一段影片，但這段影片受損嚴(yán)重，警方正在努力修復(fù)。簡文珊在等待影片修復(fù)的期間，她想見一見阿光，可阿光因凌風(fēng)入侵家中一事而報了警，現(xiàn)阿光正接受警方24小時的監(jiān)督，簡文珊不便去見阿光。這條線索被中斷，簡文珊只好提起了黑市酒吧的老板，她與凌風(fēng)同期受訓(xùn)，所以她十分清楚凌風(fēng)的查案手法，凌風(fēng)一定會去酒吧逼問酒吧老板的下落。

郭警官與簡文珊一齊來到酒吧，凌風(fēng)看到二人的身影，他查一半只好匆忙離開。簡文珊從店員的口中得知凌風(fēng)已經(jīng)來過酒吧，她與郭警官匆忙搜查。凌風(fēng)打電話給簡文珊，他明確地告訴簡文珊，他從來都沒有害過樊毅，所以他一定會證明自己的清白，簡文珊不相信凌風(fēng)，卻再一次被凌風(fēng)逃離。

簡文珊將自己的手機(jī)交給國際刑警，讓國際刑警監(jiān)聽自己的手機(jī)，若是凌風(fēng)再打電話過來，警方可以靠定位找到凌風(fēng)的位置。簡文珊對凌風(fēng)十分熟悉，她篤定凌風(fēng)下一個地點一定會回到案發(fā)現(xiàn)場的金保河。為了抓捕到凌風(fēng)，簡文珊與郭警官一同來到金保河，他們在河邊發(fā)現(xiàn)了凌風(fēng)的身影，簡文珊要求凌風(fēng)跟她一同回警局，可凌風(fēng)卻執(zhí)意不肯回去，他深知，若是他現(xiàn)在回了警局，非但證明不了自己的清白，更是找不到樊毅。