一男子醉酒后走在廢棄的廠房里，卻發現有一間屋子詭異地亮著燈，他進屋一看屋子里放著很多玻璃容器，里面盛著各個身體部位，正當他看得出神時，一個神秘男子出現了，手里拿著著鋒利的匕首……

兩名早起鍛煉的女學生在網球場發現女尸，經秦明初查后確定死因是左側頸動脈斷裂失血過多所致，雙手有捆綁痕跡，可疑的是她也失去了身體的一部分——手臂，且被擺成儀式感的樣子，這到底是為什么？眼前的女尸讓他想起林佳文案、陳瑩案、凌月案……這些案子的兇手一定存在著某種聯系。

被害人叫沈菲，剛從這個學校畢業，據說要接手家族企業。秦明因為對兇手先入為主的判斷又令他在案情分析會上和林濤起了爭執。尸檢時秦明在沈菲的口袋里發現了一個十字架，和當年凌月口袋里發現的十字架一模一樣，而且兩起案子現場發現的衣物纖維也相同，由此可以推斷兩起案子的兇手是同一個。經分析，丟失器官的死者都有一個共同點，她們在兇手眼中都屬于放棄了理想選擇了墮落，而且沈菲死前和凌陽有過七次通話記錄，凌陽在凌月案中也一直沒有排除嫌疑。林濤下令從即日起監視凌陽，而秦明則必須回避此案。

秦明苦惱自己無法控制情緒，他找師兄疏導情緒，巧遇王伶俐也約了他師兄采訪。秦明找到凌陽告訴他沈菲死了，跟殺死凌月的兇手是同一個，但凌陽始終拒絕配合，他不愿相信警察，妹妹死了十年了，兇手抓不到，自己卻被懷疑成了兇手。秦明只是告訴凌陽雖然此案十分特殊，但警察從未放棄找出兇手。

秦明找來當年負責凌月案的刑警隊長，他告訴李隊當年的兇手又出現了，李隊告訴秦明還有一個線索應該對破案有所幫助。王伶俐和秦明師兄嚴謹的訪談十分愉快，倆人一路約著下次有機會再作深談。李隊告訴秦明，當年還有一個姑娘報了案，現在想來凌月可能不是兇手的第一目標，那小姑娘很可能是這個兇手手下唯一的幸存者，如果能找到這個幸存者很可能對斷案有幫助。

又有新的命案，采石場附近發現死者，死者賈巖峰后心部中刀，死于心臟破裂，死亡時間和沈菲十分接近。珂老在賈巖峰身上發現了沈菲的血跡，也就是兇手在殺了沈菲之后又用同一把兇器殺死了賈巖峰。

方圓跟丟了凌陽，被林濤一頓臭罵。看著秦明痛苦無比，王伶俐想幫他疏導，她讓秦明給她講講他和凌月的故事。倆人的相識緣于校園音樂節，凌月的善良慢慢感染了秦明，就這樣藝術系的凌月和政法系的秦明慢慢走到了一起。沒多久凌月就在美術教室被殺了，還被兇手剜去了心臟。之后秦明就放棄了當律師的理想，選擇了法醫。王伶俐告訴秦明在凌月遇害前三個月，有一個神秘男子襲擊了一個女孩，把她迷暈了過去，然后帶到另一個地方，等她醒過來時發現自己被綁在鐵床上，滿屋充斥著重金屬音樂，她恐懼、她想逃脫，不知道是上天眷顧還是兇手作案手法不夠嫻熟，讓她找到機會割斷繩索打傷兇手頭部后逃了出來。她選擇去報警，但警察沒找到線索，這事一晃十年，這個女孩一直生活在噩夢當中。原來王伶俐就是當年那個幸存者！