法務大臣高森的妻子高森靜江被殺，死者背后有一處薄薄的刀口直插進心臟。特搜組正在加緊勘查，法務大臣高森趕到現場，聲稱妻子是被兇手誤認為是自己殺害的，恰在這時，警廳搜查四課也到了現場，并帶來了疑似兇器，說這件事應該由他們來負責，高森大臣的妻子是因為高森立主打擊有組織犯罪而遇害的。雙方言語上有些僵持，協商的結果是雙方共同調查此案。

特搜組率先拿到了死者的尸檢初步報告，針對受害人背景展開案情分析，高森靜江出身名門，身世顯赫，二十年前與還是一個課長的高森結婚，高森日后的飛黃騰達完全依賴于妻子的家族。高森和妻子經常出現在公益場合，穿著同款的衣服，特搜組分析可能是因為著裝，致使兇手將靜江誤認為是高森予以殺害。淺輪卻發現了帽子的不同之處，而且沒有死者本人的指紋，他懷疑是有人殺了靜江以后故意戴上去的。而就在這時，法醫來告知特搜組，死者背上的傷口被人刺了兩刀，外套上卻只有一個刀口，這就說明死者先是被殺，然后被兇手披上外套再補了一刀，偽造她穿著外套死的假象，這一切的目的，就是為了讓警察相信，靜江因為穿著同樣的外套被誤當作高森刺死。

警廳總監找來宗方和淺輪，透露宗方的真實身份是抓內部犯罪的“秘密部隊”，同時宣布，五年前的案件和一年前致使特搜9系解散的案件，還有眼前的案件并案偵查，法務大臣高森很有可能與這三起案件都有相關。宗方回憶前兩起案件，每一起都有正義的警員被誣陷自殺，而且第二起直接導致了9系的解散。特搜組憋著一股勁，一定要把三起案件的真相查出來。

新藤亮順著兇刀的線索追查到了黑社會小頭目須山，并將他逮捕。然而這卻是高森讓人布置的一個圈套，須山有不在場證據，試圖陷害新藤亮背黑鍋。

特案組在調查死者靜江的社會關系時發現，她很可能與川勝有不正當關系，而川勝則是第一起案件里死者的男朋友，與嫌疑人的死也大有關聯。特搜組認為川勝是第一起案件的兇手，也因此被高森要脅，按此推斷，他可能也是殺害靜江的兇手。就在案件要水落石出時，特搜組被部長勒令解散，解散命令還有半天即生效。

利用這半天時間，特搜組也做了一個大圈套，他們冒充和高森有關系，逼得川勝無處可逃，第二天清晨，川勝沖進記者中間，把高森所有的陰謀全部公諸于眾，而特搜組在解散令正式下達前五分鐘，逮捕了川勝和法務大臣高森。經過提審，案情如預料一般真相大白，警局內部也挖出了安達課長，致使多名警員冤死的罪惡得以昭彰。而特搜組如愿保留，一樁樁新的案件等待他們偵破。