日本外交官黑田康作受上司安藤庸介保護國人的秘密命令，在世界各地為工作奔走，解決了南美發生的日本人綁架案之后，黑田的下一個目的地是圣弗蘭西斯科，目的是保護為參加WTO農業交涉會議在外訪問的外務副大臣觀上祥子。

來到圣弗蘭西斯科之后，黑田先確認了會議的竟被狀況，又去和情報屋見面，詢問FBI的行動，之后又去和外交官霜村毅見面。11年前，黑田曾和霜村一起在墨西哥的領事館工作，關系很好，分別之際，霜村還給黑田留下了“對不起”的一句意義不明的話。

與此同時，日本發生了一件大學教授被殺案件，尸體的第一發現人是刑警大垣利香子，她對上司說現場情況有些怪，但沒人聽她的意見。有人想在農業交涉會議襲擊祥子，但多虧黑田沒能得手，他懷疑有內奸，于是單獨在事件現場進行調查。祥子到美國之前曾有些麻煩，外務省因為牛肉出口制度遭到民眾批評。另一方面，教授被殺事件也憑借足跡、指紋等找出了嫌疑犯，嫌犯正是霜村。