崔大賢與武元通過視頻會面，他提條件要求還秘密要員以清白。

政府未能遵守條件逼急了鄭尚俊，鄭尚俊槍殺劉振宇后欲擴散病毒，崔大賢與鄭尚俊反目身受重傷，他臨死前將阻止鄭尚俊的重任交給搜查科。

鄭尚俊與馬尚旭在各處安裝病毒炸彈，武元等人分頭行動阻止病毒擴散。健宇血戰馬尚旭拖延時間，泰平成功解除爆炸裝置，武元在敏珠的幫助下將鄭尚俊擊斃。

病毒最終沒能擴散出去，搜查科也得以保全繼續暗中守護國家。

(大結局)